اولا اینکه از چه کامپایلر و چه Ide استفاده میکنی؟
ثانیا این میتونه به این بستگی داشته باشه که تو فایل پروژه دست برده باشی
مثلا اگه یه فایل sln تو ویژوال استودیو دارین باید همون جوری که هست بازش کنین نه با نوتپد یا وردپد و غیره و دستکاری کنین
من به شما MinGW و Code::blocks رو پیشنهاد میکنم
یه سرعت خیلی خفنی داره
هم تو ران و هم تو مدیریت برنامه و سی پی یو
فقط بدیش اینه که حجم exe رو زیاد میکنه
اونم به خاطر لینکینگه