سلام
می دونید که Selector واحد اصلی در MooTools، متد $ هست که چند تا فریم ورک دیگه از جمله jQuery و prototype هم از همین نام استفاده می کنند و این اصلی ترین علت Conflict و تداخل فریم ورکها در صفحه است.
jQuery متد noConflict و چند تا روش رو معرفی کرده و MooTools از نسخه 1.2.3، متد جدیدی از شی document با نام id ارائه داده که دیگه هیچ شباهتی به بقیه نداره.
document.id('myDiv') === $('myDiv')
این یعنی تا این تاریخ که نسخه 1.2.4 عرضه شده اگر MooTools رو گرفتید، دیگه لازم نیست از متد $ استفاده کنید و ناراحت تداخل فریم ورکها باشید.
موفق باشید
امیرحسین
پاسخ با نقل قول