شما آرایه ای از لیست پیوندی تعریف کردید یعنی هر خانه از آرایه شما خودش یک لیست پیوندی است.
حذف clusters[2] به معنی حذف خانه ای از آرایه است!
اگر قصدتان حذف گره ای خاص از یک لیست پیوندی خاص است می تونید از متد Remove استفاده کنید:
clusters[2].Remove(data table13);
احتمالاً اشتباه کار کردید، اگر علامت [] رو از تعریف clusters حذف کنید شاید اوضاع کمی مرتب تر بشه:
LinkedList<DataTable> clusters = new LinkedList<DataTable>();
clusters.AddLast(data table11);
clusters.AddLast(data table12);
clusters.AddLast(data table13);
clusters.AddLast(data table14);
clusters.Remove(data table12);