protected void Button1_Click(object sender, EventArgs e)
{
Process p = new Process();
p.StartInfo.FileName = "notepad.exe";
p.Start();
}

میبایست مد نظر داشته باشید این کد برای اجرا کردن فایل ها در سرور است، نه در کامپیوتر کلاینت.