به طوریش فرض، با فشردن کلید اینتر، تگ <p> در متن html نوشته می‌شه که به دلیل فاصله‌ییش فرض میان پاراگراف‌ها، مشکل شما پیش می‌آید.
یک راه، زدن کلیدهای Shift+Enter است که < br > می‌اندازد.
روش دیگر، تنظیم خود fckEditor با استفاده از خصوصیت UseBROnCarriageReturn است. به این ترتیب:

<FCKeditorV2:FCKeditor ID="Editor1" runat="server" UseBROnCarriageReturn="true" />