همیشه گنو لینوکس سیستم عامل های خوبی داشته
سیستم عامل raspbain خود بنیاد raspberry pi بسیار سیستم خوبی هست. با توجه به اینکه نسخه ای از debian 8 هست و به زودی ایمیج تازه ای بر مبنای debian 9 بیرون میدن.
البته گزینه های دیگه ای هم مثل اندروید و winddows IOT هم دارید، ولی به نظر من فعلا raspbain گزینه ایده آل تری هست.