شما نیازی به تغییر نام فایل ها ندارید و می تونید این دوتا کلید رجیستری را تغییر بدید

HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows NT\CurrentVersion\Winlogon
و مقدار Userinit یا Shell را برابر مسیر برنامه قرار بدید