مشکل از همون هدرها هست
باید به هدر Content-Type رو برای فایلی که کدهای CSS توی اون هستن مقدار text/css بدی درست میشه
این کارو هم میتونی با استفاده از زبانهای سمت سرور انجام بدی مثلاً وقتی که فایل css باید توسط یک اسکرپت داینامیک ایجاد بشه و هم اینکه توی تنظیمات سرور هدرهای اون پسوند رو تنظیم کنی
روش اول تو Php میشه قرار دادن این کد اول صفحه css البته در صورتی که اون فایل به وسیله مفسر php خونده بشه یعنی مثلاً اگر پسوندش php باشه:
header("Content-Type: text/css");
روش دوم هم بستگی به سرور داره برای آپاچی میتونی از فایلهای htaccess استفاده کنی