id می تونه هر اسمی باشه. در دستور زیر id کنترل رو به جای Editor بذارید.

 <script>

        $(document).ready(function() {

            $('#Editor').ckeditor();

        });

    </script>
آدرس ها درسته؟ کد صفحه aspx رو بذارید. و اگه می تونید پروژه رو ضمیمه کنید.